Referencam lahko pripnemo praktično katero koli vrsto datoteke. Vsaki referenci lahko dodamo do 45 datotek.
Datoteke lahko dodajamo ročno, ali pa jih za nas na spletu poišče EndNote.
Ročno dodajanje priponk:

Avtomatično iskanje PDF-jev. Najprej označimo reference, nato kliknemo v meniju na Find Full Text.

V meniju vidimo število najdenih PDF-jev in število najdenih URL-jev.
